Cuando el mundo está en problemas la organización recurres a sus agentes secretos top: Carmen y Juni Cortéz (Alexa Vega y Daryl Sabara respectivamente) . Ellos están de vuelta para otra aventura en “Mini Espías 2: La isla de los sueños perdidos”. Su nueva misión los traslada a una misteriosa isla donde conocen a un inventivo y alocado científico genetista (Steve Buscemi) y sus imaginativas criaturas mientras deben combatir las fuerzas de otros niños espías: Gary y  Gerthy  Giggles (Matt O’leary yEmily Osment). Sin saberlo se dirigen hacia una trampa que pondrá a prueba a cada uno de los Cortéz, desde los niños, pasando por los padres, hasta sus abuelos espías (Ricardo Montalbán y Holland Taylor). Este verano Carmen y Juni enfrentarán una misión tan grande que deberán llevar con ellos a toda su familia.